يعتبر هذا المشروع من أكبر مشاريع الهيئة الحالية ويهدف إلى توفير الرعاية والخدمة الطبية المجانية لتأهيل مصابي الدماغ والنخاع الشوكي في ثورة ديسمبر المجيدة وتوفير خدمة مرجعية في السودان في هذا المجال. كما سيشكل المشروع نواة لدعم إنشاء وإدخال تخصص الطب التأهيلي في السودان.
سيتم إكمال المشروع على مرحلتين:
١- وحدة تأهيل الحالات فوق الحادة بمستشفى الخرطوم التعليمي.
٢- وحدة تأهيل الحالات الحادة بمستشفى سوبا الجامعي.